月经来的第一天头疼，主要原因有以下几种：

1.可能是出现了经前期紧张综合征，月经来的第一天由于体内雌性激素和孕激素分泌紊乱，可能会对大脑神经系统造成影响，会出现头痛症状。这是正常的生理反应，一般不必治疗，2~3天后就会逐渐恢复。

2.部分患者头痛也有可能跟身体抵抗力过差、睡眠不足等各种因素有关。

3.月经来的第一天头疼也不能排除其他可能，比如感冒着凉后也可能会出现头疼症状。需要了解产生原因后对症治疗，最好不要盲目用药。