肠炎和肠结核的区别，疾病的原因不同。在临床表现上也有所不同。

引起肠炎主要的病原微生物是细菌或者病毒的感染，而引起肠结核，主要是结核分支杆菌的感染。

肠炎主要表现为腹胀、腹痛以及大便次数的增多，部分患者可能会出现反复发热等症状，而肠结核除了上述临床表现以外，还可能会出现结核中毒症状，表现为乏力、低热、盗汗。并且患者如果出现了肺转移时，还可能会出现反复的咳嗽、咳痰、咳血等症状。

因此在治疗时两种疾病选择的用药也有所不同。肠结核的患者需要口服抗结核药物，必要的时候有可能需要通过手术治疗。