对于巧克力囊肿的女性，由于巧克力囊肿的大小不同，所以巧克力囊肿能怀孕的几率到底有多少，这得根据每个人的具体情况来判断。只是根据统计的数据发现60%以上的巧克力囊肿患者都是可能自然的怀孕，所以绝大部分女性在患有巧克力囊肿以后，通常是可以怀孕。

而对于巧克力囊肿比较小的女性，就应该先进行备孕怀孕，因为在怀孕以后可以使巧克力囊肿萎缩变小，甚至使巧克力囊肿完全彻底的消失。

但对于巧克力囊肿太大的女生，常常可能需要先行手术将巧克力囊肿切除，手术后再进行备孕。