先天性肠闭锁目前研究表明，有少部分遗传的因素。家族中如果有过此类病例，后代中出现此类病变的几率要大一点。

先天性肠闭锁主要的病因，是胚胎时期肠道发育管腔化的过程中出现异常，或者胎儿时期肠道发生缺血、坏死所导致的。如果害怕有先天性肠道闭锁疾病，孕期可以做详细的产检，通过B超检查一般都可以发现先天性肠闭锁。

即使生下来的婴儿有先天性肠闭锁，也不必担心。目前先天性肠闭锁手术技术非常成熟，手术治疗效果非常好，只要及时恰当地进行治疗，一般没有很大的后遗症。