妊娠呕吐首先需要跟急性胃肠炎进行鉴别，因为二者的临床表现非常相似。急性胃肠炎也会有恶心呕吐的症状，但是急性胃肠炎追问病史大多会有不洁进食史。同时急性胃肠炎，呕吐的多为胃内容物，胃内容物具有一定的恶臭味道，还伴有腹泻的症状、伴有腹痛的症状。而妊娠呕吐表现为恶心，呕吐的症状，或者是进食越来越少，呕吐物不会有恶臭，同时也不会有腹部疼痛的症状。

其次妊娠呕吐还需要跟一些急性脑膜炎这些神经系统疾病鉴别。神经系统疾病导致的呕吐，是一种剧烈的喷射样的呕吐，同时伴有头疼、头晕或者其他神经系统的症状。

妊娠呕吐的女性，有停经现象、血HCG水平升高，而其他疾病引起的呕吐，血HCG水平是正常的，也没有停经情况，相比较容易鉴别。