腹部超声与直肠超声是使用同一台机器进行检查，而应用不同的功能，使用的探头和检查内容也不同。

腹部超声是应用普通的低频超声探头，经由腹壁来检查腹部器官，例如肝、胆、胰、脾、双肾等器官的疾病，并且无损伤、无痛感。

而直肠超声检查是把腔内超声探头直接插入直肠内进行检查，主要是来检查直肠的疾病，例如直肠的炎症、直肠息肉、直肠癌以及内痔等等，并且还可以应用直肠超声来检查前列腺以及一些妇科疾病。在检查时虽然无损伤，但是会有一定的疼痛感。