超声肠镜和肠镜的区别主要有以下几种：

第一，检查器械不同。超声肠镜在其头端带有超声探头，而普通的肠镜并没有超声探头。

第二，检查目的不同。普通的肠镜主要是全面的观察肠道黏膜是否有异常的肿物、赘生物，是否有糜烂、溃疡以及出血等。超声肠镜主要是针对某个部位病变的检查，例如肠道肿瘤的患者，可以通过超声肠镜判断肿瘤向肠壁侵犯的层次，深度以及周围淋巴结是否有肿大。还可以在超声肠镜引导下进行肿块穿刺，取活组织行病理切片检查。

第三，两者检查的费用也不相同。超声肠镜检查的费用要高于普通肠镜。