有一部分肛瘘发生了六年是有可能变成癌的。虽然大部分肛瘘是由直肠肛管周围脓肿所引起的，癌变的几率会比较低，但有一少部分肛瘘继发于肠道的结核、溃疡性结肠炎、克隆氏病等特异性炎症。

这些慢性肠道的炎症性病变可以造成肠道黏膜的反复损伤。而在反复损伤和修复的过程中，就可能发生非典型增生，最终导致癌变现象的发生。

所以对于确诊了肛瘘的病人，应该给予积极的手术的治疗。在手术当中，可以将瘘管切开，形成敞开的创面，帮助肛瘘的愈合。