经常便秘跟肛瘘的发生是有关系的。

肛瘘的发生是由于肛内的肛隐窝处受到损伤，发生了细菌感染。炎症顺着肛腺导管，扩散到肛门周围正常组织内及肛周皮下，形成肛周脓肿。肛周脓肿破溃后脓液流出，溃口逐渐收敛成瘘管及外口，这就是肛瘘的形成过程。

经常便秘意味着大便会干燥质硬，在通过肛隐窝时就容易将肛隐窝处的组织划伤。肛内的细菌就会感染受伤的组织，逐步发展成肛周脓肿及肛瘘。