睾丸囊肿和疝的区别是发生部位、内容物以及伴随症状不同，可辅助彩超检查进行准确区分。

前者睾丸囊肿好发于睾丸的头部，囊肿内有大量精子，较小的囊肿无任何感觉，囊肿测值过大，对局部造成压迫，可伴随睾丸部位坠胀、隐痛不适。而后者疝是由于鞘状突关闭不完全而导致的解剖结构缺损，其内容物是肠管、大网膜等。仰卧位腹腔压力减小，疝囊可回纳至腹腔内，疝囊自行消失。咳嗽、运动等导致腹腔压力增加，即可导致疝囊脱出，阴囊部位可见明显包块。

此外，手术方式也是不同的。