怀孕初期有咖啡色分泌物，提示有先兆流产情况。先兆流产的患者流血量少，血在阴道内存留时间长，所以会呈现分泌物呈咖啡色。

这种情况可以到医院做抽血检测，一般做血清绒毛膜促性腺激素和孕酮检查。然后根据这两项检查，判断先兆流产原因，然后根据情况来进行调理。同时一定到医院做彩超，看胚胎在宫腔内发育情况。

如果是先兆流产情况，保胎对症治疗。如果是不能排除宫外孕，一定到医院做好相关检查，对症治疗。