功能性大便失禁在早期多呈现不完全性肛门失禁。对于干便可以随意控制，在稀水样便和肠内分泌物的控制欠佳。

常常造成患者肛门周围皮肤感染和肛周湿疹的发生，致使肛周潮湿黏滑、骚痒感，给患者带来身体不适和生活工作不方便。病程早期患者的肠道功能未受明显影响。

随着病程的进展，逐渐对干便也难以控制。粪便和肠道分泌物、气体自肛门随意流出，尤其在咳嗽、打喷嚏、下蹲时更加明显。患者往往不敢进食和活动，造成消化不良、消瘦、贫血和精神苦恼。