孩子发烧眼睛疼可能是以下原因：

1.持续性的发烧没有得到有效控制、体温上升过高，加快了人体的新陈代谢。由于发烧时造成血管扩张，引起眼压升高导致眼睛疼痛。

2.也有可能是眼睛受到细菌或者病毒感染引起结膜炎，导致眼睛疼痛、眼睛发红、眼睛分泌物增多。

出现高烧时，要给予布洛芬混悬液退烧处理。眼睛受到感染可以给予抗感染的药物，比如更昔洛韦滴眼液、左氧氟沙星滴眼液等药物治疗，但是需要在医生的指导下应用。同时要注意眼部卫生，不要让孩子揉眼睛，以免加重感染。