肛瘘术后大便失禁，其原因可能是做手术时损伤了肛门括约肌。肛瘘可分为低位肛瘘和高位肛瘘，低位的肛瘘只有一个内口和一条瘘管，可以做肛瘘切除术，手术比较简单，手术后伤口愈合较快。

但如果是高位的肛瘘，由于位置较深，有多条瘘管、多个瘘口，情况较为复杂，需要做挂线手术。如果在手术过程中损伤了内括约肌，或者括约肌切除过多，在伤口没有完全愈合前，就会出现肛门括约肌功能障碍，从而引起大便失禁。

所以复杂性的肛瘘一般选择肛瘘挂线术，其目的是避免损伤括约肌，避免出现大便失禁。