矮小症是有必要查基因。因为矮小症主要的原因分为原发性和继发性，而原发性主要是由于一些遗传性疾病导致的基因突变，从而出现生长发育迟缓、矮小的问题。此时可以做染色体检查，明确异常基因，找到基因突变的位点。

矮小症继发性的原因主要是下丘脑或垂体的损伤，如外伤、感染、手术、肿瘤等引起。此时需要明确矮小症的病因，根据病因制定合理的治疗方案，积极治疗。

尽量找到矮小症的原因才能更好地进行后续治疗，所以建议查基因。