面瘫导致头疼、耳朵疼，主要是因为病毒侵犯面神经，造成面神经炎症水肿。

而水肿的面神经在面神经管内走行时，会受到卡压，从而刺激神经造成疼痛的感觉。面瘫合并头疼、耳朵疼，临床上称为亨特氏综合征。这类患者需要给予阿昔洛韦或者更昔洛韦抗病毒治疗。同时需要给予糖皮质激素，减轻面神经的炎症和水肿。

此外，还可以给予非甾体消炎止痛药，或者抗癫痫药物止痛、对症治疗。一些患者还可以给予热敷、针灸、红外线照射等手段控制疼痛。