怀孕三个月发烧38度，要分析原因，根据不同的病因，采取不同的办法。如果是感冒病毒侵犯机体，使全身产生炎症反应导致的发烧，要服用一些抗病毒药物，如奥司他韦胶囊抗病毒治疗，服用一些中成药，如莲花清温胶囊、板蓝根冲剂来对症处理，避免受凉，注意保暖，多喝温开水，多吃新鲜的蔬菜和水果。如果是细菌感染引起的，降钙素原白细胞异常升高，会出现咳嗽咳黄脓痰，要根据痰培养药敏的结果，选择一些副作用小的抗生素，如青霉素类、头孢类的抗菌药物进行治疗，防止病情的加重，以免影响到腹中胎儿的正常发育。