脑溢血本身很少会导致阵发性心房纤颤。房颤多是心脏本身的问题引起的心律失常，而房颤的出现可能会导致脑血管病加重。

因为心房颤动会在左心房产生血栓，当左心房的血栓脱落时就会进入大脑，脱落后进入左心室，左心室被阻断一半后，它会通过主动脉进入大脑，并发生血栓。

另一个原因是许多房颤患者是由风湿性心脏病引起，风湿性心脏病瓣膜本身可能有风湿结节或钙化点，如果这些东西掉到大脑里，也会引起脑梗死。