孤立性直肠溃疡综合征是一种比较少见的疾病，会出现肛肠疾病的所有症状。但是病程大部分比较缓慢，有时候可能需要几个月或者是几年。发生便血的几率在80%以上，一般数量比较少，偶尔可能会出现大量的便血。

也会出现排便困难，又或者是便秘等症状，甚至还可能会觉得直肠部位有阻塞感，可以适当的用手指来促进排便。

也有一些病人可能会出现明显大便失禁，甚至有部分的病人左下腹会伴有压痛的感觉，拉出粘液大便。疼痛的位置主要是出现在会阴部位，或者是直肠肛门部位。