女性患有巧克力囊肿需要根据女性年龄、巧克力囊肿体积大小、对生育的要求、临床症状来决定。

女性如果年龄偏大接近绝经，临床症状比较轻微，巧克力囊肿直径比较小，可以动态观察，每半年到一年复查一次。

对于痛经现象比较严重的女性，也可以用药物提前绝经改善症状或者上曼月乐环减少月经量，缓解痛经。对于生育期的女性有生育要求，巧克力囊肿直径大于3cm，临床症状比较严重才考虑手术治疗。