慢性肾盂肾炎的治疗往往需要采取综合治疗的措施。首先，患者要注意个人卫生、增强体质，这样可以提高机体抗御疾病的能力；平常要多饮水、勤排尿。第二，要纠正尿路感染的各种复杂性的因素，比如如果患者存在尿路结石、梗阻、畸形的情况下，积极的利用手术或者其他的手段，尽早的解除尿路结构的异常。第三，就是抗感染治疗，对于反复发作的慢性肾盂肾炎患者，如果通过尿细菌培养确定病原菌以后，要进行针对性的抗感染治疗。当然也可以选择两种抗生素联合治疗的方法，治疗的时间一般至少是2到3周。当然，对于慢性肾盂肾炎后期的患者，如果有合并肾功能不全，应当采取药物保护肾功能进行治疗。