导致小孩子在半夜出现肚子疼的原因，考虑有以下几个方面：

1.孩子的肚子着凉。在夜间睡觉的时候孩子踢被子，所以导致腹部里面的脂肪酶、淀粉酶活性受到影响，对孩子的食物消化功能造成影响，所以这个时候就会出现肚子痛的现象。

2.跟孩子存在着肠系膜淋巴结炎有关系。因为这种疾病是孩子最常见的导致肚子痛的疾病，一般疼痛部位是以脐周围为主。

3.如果孩子存在着肠梗阻疾病，也有可能会在半夜的时候出现肚子痛得厉害、明显。