坐下起来肛门就疼，首先就是考虑有肛裂的情况，另外也不排除有痔疮的可能性。痔疮和肛裂都是肛门处的常见疾病，在坐下起来以后，肛门的局部受到影响，可以出现疼痛的症状。另外，就是排除是不是有肛门周围脓肿或者是肛瘘等感染性的疾病存在。如果发生了局部的感染，肛门周围的组织会发生坏死，并且会有脓液形成，会在坐下起来以后肛门出现疼痛的症状。

建议患者找到正规医疗机构的肛肠科进行就诊，一般通过肛门局部的望诊、肛门指检、肛门镜的检查就可以明确诊断。

在诊断明确以后，主要的治疗方法是通过药物进行治疗，或者是通过手术的方式进行治疗。如果进行手术治疗，在手术以后一定要按时换药，促进伤口的愈合。