子宫腺肌病可以与子宫肌瘤、盆腔子宫内膜异位症、功能性子宫出血等进行鉴别诊断。

但是一般根据患者典型的进行性痛经，和月经过多的病史以及做妇科查体，看到子宫均匀增大或局限性隆起、质硬、有压痛，就可以做出初步的诊断。通过做彩超看到病灶的形态与周围组织的界限，可以辅助诊断。子宫肌瘤的患者一般不伴有痛经，妇科检查子宫增大，但无压痛，子宫的活动度好，B超检查子宫肌壁肿块与周围组织界线清楚。

盆腔子宫内膜异位症的患者有痛经，在盆腔也可触及到包块，但是子宫正常大或稍大，B超检查可见一侧或双侧附件包块。