附睾结核主要是同附睾炎症相鉴别，因为结核属于特异性的一种细菌感染，主要是由于结核分枝杆菌感染引起，而对于慢性附睾炎一般由大肠杆菌或者其他细菌感染引起，以及特殊的衣原体附睾炎和淋球菌性附睾炎，也会导致附睾炎症表现。

如附睾在急性发作期间会出现红肿、热、痛等表现，一般摸起来较为柔软、肿大，而对于结核引起的附睾炎，患者一般存在附睾硬结、与皮肤粘连以及输精管有典型的串珠样改变，在部分严重的患者当中还会存在窦道，这些都需要与慢性普通细菌引起的附睾炎相鉴别。