肺栓塞的发病原因主要是由于血液淤滞、静脉管壁损伤和高凝状态，只要存在上述三种因素，都容易发生肺栓塞。

肺栓塞是肺外面的血栓阻塞到肺动脉和肺分支所引起的，主要是因为各种栓子阻塞了肺循环而诱发的疾病，大多数的栓塞来源于下肢深静脉或者盆腔静脉系统，主要是一些长期卧病在床或者久坐不动、手术恶性肿瘤，以及长期口服避孕药的病人容易引起此病。

除次之外，还有脂肪栓子、空气栓子、骨髓、寄生虫和临床可以见到的一些菌栓，都是导致肺栓塞发病的原因。