凌晨腹泻厉害时可以服用止泻药物缓解腹泻，并及时补充水电解质以免脱水。另外，应查明引起腹泻的原因，针对病因进行治疗。

引起腹泻的原因，可能与饮食不洁、食物中毒、腹部受凉、肠系膜淋巴结炎、急性胃肠炎、结肠炎等有关，可以通过血液检查、大便检查、腹部彩超、内镜检查等明确诊断。

如果是饮食不洁导致的腹泻，应注意饮食卫生。如果是细菌或寄生虫感染导致的腹泻，严重时可以使用抗菌药物进行治疗。应密切观察患者的病情变化，有无高热、神志不清、少尿、昏迷等症状，出现上述症状时应立即就医。