喝完酒以后，肩膀疼痛的原因有以下几点：

第一个，就是喝酒，特别是醉酒以后，大脑对于神经肌肉的控制有所减缓，这时有可能一些过于劳累或者有可能扭伤的情况保护不够，并且有可能会加重局部的挫伤或劳累的情况。比如提过于重的东西，或者在大脑对局部肌肉控制减轻的情况下，做一些比较超出以前运动能力的动作。在醒酒之后这些部位因为肌肉的粘连渗出会产生剧烈的疼痛。

其次，是喝酒会对局部一些慢性疾病产生一定的刺激。像有些关节炎、痛风以及局部的滑膜炎等，都可能因为喝酒加重刺激，从而在酒后出现疼痛。

这些情况都需要在疼痛严重时注意休息，不缓解及时检查对症治疗。