小儿营养不良的药物治疗主要是针对提高患儿食欲和消化能力，从而使患儿营养吸收增多，达到纠正营养不良状态的目的。

可以口服胃蛋白酶、胰酶及维生素B族提高胃肠道消化能力，可以肌注小剂量胰岛素，降低血糖，增加饥饿感，提高食欲，可以补锌提高患儿味觉的敏感度，增加食欲，还可以口服中药参苓白术散，同时给予针灸、推拿等调理脾胃功能，改善食欲。

以上方法均需要在医生的指导下，按照孩子营养不良的具体情况，制定个体化的治疗方案。