吃万古霉素胶囊不建议喝咖啡。因为服用药物本身就容易对胃肠造成不适，而咖啡又属于有刺激性的食物，服药期间喝咖啡会使消化道的负担加重，这就有可能会引起腹部不适。

而且用药治疗疾病期间，需要保障良好的睡眠质量，这样才有利于疾病的治疗。但是咖啡中含有咖啡因等物质，其有兴奋神经的作用，喝咖啡后容易引起失眠，会导致睡眠障碍。所以，从这一方面，服用万古霉素胶囊治疗疾病期间的患者，应该少喝或者尽量不喝咖啡为好，以免影响病情的治疗。