鹅口疮和手足口病的区别主要有以下几点：

第一，感染的病原菌不同：鹅口疮感染的病原菌是真菌，以白色念珠菌为主。而手足口病感染的病原菌是肠道病毒，临床以柯萨奇病毒A16型和肠道病毒71型为主。

第二，症状表现有所不同：鹅口疮的患儿一般情况下不会出现发热的症状，而手足口病患儿通常会伴有发热的症状。并且鹅口疮典型的症状是口腔黏膜会出现白色的膜状物，而手足口病典型的症状是以口腔黏膜出现水疱疹，以及手、足等部位的皮肤出现水疱疹为主。