女生小腿骨头疼痛，可能是由于长时间地不活动、突然的跑步或者剧烈运动，导致小腿骨头上的肌肉附着点，出现了疲劳性的损伤，引起无菌性的炎症，刺激局部的软组织出现疼痛的症状。

也不排除是由小腿本身的疾病导致的，比如小腿骨头出现原发性的骨髓炎、骨头内出现占位性病变等，以及疲劳性的骨折，都会引起小腿骨头疼痛的症状。

还有可能是由于骨关节炎引起的，严重的膝关节骨性关节炎、髋关节的重度病变，以及类风湿性关节炎，都会引起女生小腿骨头出现疼痛的临床症状。也不排除是由于腰椎间盘突出症、腰椎管狭窄等压迫神经，导致小腿神经受压以后出现的骨头疼痛。