乙肝大三阳和乙肝小三阳的区别在于是三种不同的抗原抗体阳性。

乙肝大三阳为乙肝表面抗原，乙肝E抗原和乙肝核心抗体三项阳性。乙肝小三阳是乙肝表面抗原，乙肝E抗体和乙肝核心抗体三项阳性。一般来讲乙肝大三阳的患者病毒载量很高、传染性很强。乙肝小三阳的患者病毒载量低甚至是阴性，它的传染性也是很低。

发生乙肝大三阳时往往提示患者的病情在免疫耐受期，这时期患者的肝功能往往是正常的，肝脏的炎症水平可以是轻度炎症或者是正常。乙肝小三阳患者往往在疾病的低复制期，肝功能可以正常或有轻度的异常，肝脏病理学可以正常或有轻度的炎症。