龟头流脓伴疼痛可能为龟头炎疾病所引起，通常还伴有局部红斑、肿胀等症状，患者应尽早去医院的泌尿外科进行检查和治疗。

如果龟头炎为普通细菌感染所引起，应当先使用碘伏溶液进行局部消毒，然后再外涂百多邦软膏进行治疗，如果感染比较严重，还可配合口服抗生素类的药物进行治疗，比如左氧氟沙星胶囊、头孢地尼等。

如果龟头炎为真菌感染所引起，先使用低浓度的高锰酸钾溶液进行清洗，然后外涂氟康唑软膏进行治疗，在治疗期间，患者应禁止性生活、注意生理卫生、禁忌烟酒、清淡饮食、多注意休息。