发生药物性甲状腺功能减退症时产生的情况不一样，所用的药物处理方法也是不一样的：

1.核素碘-131治疗甲状腺疾病以后所导致的药物性甲状腺功能减退症，一般是给予左甲状腺激素替代治疗。根据心功能的情况，从小剂量开始，逐渐加至能够完全替代的剂量。这种患者大多数是需要终身服药的。

2.在治疗弥漫性甲状腺肿伴甲状腺功能亢进症时，使用了甲巯咪唑或者是丙硫氧嘧啶，发生药物性甲状腺功能减退症。这时应该减少上述药物的用量，并增加左甲状腺激素，以调整甲状腺轴的功能随着病情的逐渐好转，药物可以逐渐减量。这种情况多是由于患者甲状腺激素没有定期检查所造成，经过及时处理，上述情况是可以缓解的。