女性患有巴氏腺囊肿的时候，需要根据囊肿的大小、出现时间的长短、女性的一些具体要求来决定如何治疗。比如，有的女性是偶然发现巴氏腺囊肿，体积比较小，没有任何的临床表现，并且长期存在，可以动态进行观察，注意保持会阴部的清洁，避免诱发感染就可以了。还有一些女性的巴氏腺囊肿体积逐渐增大，并且反复发生感染，形成脓肿，对于这一部分女性可以做前庭大腺囊肿的造口手术或者是前庭大腺囊肿的剥除手术。对于前者这种手术方式创伤比较小，可以保留腺体的正常功能，在同房的时候，可以分泌前庭大腺液，起到一个润滑的作用，但是有发生复发的可能。后者这种手术方式创伤比较大一些，并且破坏了腺体的功能。