胎儿畸形有一大部分人群是和遗传有关的，比如有的有唇腭裂、多指、肢体畸形等，也就是有很多的畸形问题是可以找到家族史的，有家族畸形的历史更是要加强产前检查的。

但是大多数的畸形问题或者胚胎停育或者是自然流产，是因为胚胎自身染色体发生突变而导致的，也不一定是遗传的问题，比如有部分的肢体发育异常等。也有的人发生胎儿畸形的问题是因为孕妇的血糖过高，或者是有各种病原体感染，比如衣原体感染，或者是梅毒感染、巨细胞病毒感染等，都可能会导致胎儿畸形的，所以引起胎儿畸形的原因是比较多的。