肾区两侧隐痛有可能是以下的原因引起：

第一，泌尿系统感染。特别是因为肾盂肾炎，一旦发生感染以后可以出现肾区疼痛伴有发烧、尿频、尿急的症状。

第二，泌尿系统结石。结石包括肾结石、输尿管结石，由于结石卡在输尿管口导致出现梗阻，引起肾脏积水导致，腰部出现强烈的疼痛感。

第三，急性的肾脏疾病。当肾脏出现明显的水肿时，可牵拉到肾包膜发生疼痛，还可能伴有肾功能改变、血压升高、排血尿、恶心、呕吐的症状。

第四，腰肌劳损、腰椎骨质增生、腰椎间盘突出等，都可以引起肾区两侧隐痛，需要完善相关的检查才可以明确病因给予对症治疗。