巧克力囊肿，一般情况下不需要做活检。因为巧克力囊肿是因为子宫内膜脱落后，异位到卵巢后，在卵巢部位植入，随着月经周期引起出血，血液不能排出，淤积在卵巢内逐渐形成囊肿；所以，巧克力囊肿，一般都是良性囊肿，不会发生癌变。

但是，巧克力囊肿会引起明显痛经症状；而且，随着囊肿逐渐长大后，还会影响卵巢功能，导致卵巢内分泌失调，严重的甚至会影响怀孕等。

而且，囊肿逐渐长大，有时候还有可能会出现破裂等现象，引起大出血，所以需要手术治疗，手术后需要做病理检查。