肛周脓肿是因肛隐窝内的肛腺感染，化脓后脓液沿着肛腺导管扩散，到肛门周围的软组织及肛门皮肤，导致范围较广的感染性化脓性疾病。

痔疮是因肛垫下移，肛垫内的痔静脉丛扩张，淤血形成的血管团。这两种疾病有着本质上的区别，前者是感染化脓，后者是软组织增大。两者的治疗方式也不一样，脓肿需要行脓肿切开引流或脓肿根治术。

痔疮需要切除病变的肛垫及血管团，以达到缓解症状，恢复正常生理结构为主要目的。所以痔疮是不能根治的，还有复发的可能。而脓肿只要清除干净，一般不容易复发。