肛瘘可以癌变。肛瘘的特点是肛门周围瘘口周期性、持续性排出大便残渣、脓性或者血性渗液，周而复始，难以自愈。常需要手术治疗才能痊愈。

在众多的患者中有很大一部分，采取保守治疗肛瘘，比如进食粗纤维食物、戒烟酒、多运动，增强体质，增强直肠局部防御力。便后及时清洗肛门，因为肛瘘的症状可以忍受，一再延迟就医。

因为肛瘘瘘管长期排出渗液，有很强的腐蚀性和感染性。反复长时间刺激肛周皮肤很容易引起肛周皮肤感染，感染引起基因突变导致肉芽异常增生，引起肛瘘癌变。