肛门右侧内有小疙瘩，首先需要进一步明确诊断，一般需要做肛门镜检查，在直视下对小疙瘩进行观察，同时还可以做肛门指诊，以及直肠内超声检查，或者肛周磁共振检查。肛门内侧有小疙瘩，不排除是肥大肛乳头，或者肛乳头瘤的情况，如果没有症状可以先观察为主。

另外，也要排除是不是有尖锐湿疣的情况。尖锐湿疣属于性传播疾病，患者往往有不洁性生活史。在感染尖锐湿疣病毒以后的3周到3个月内会有疣体生长。主要治疗方法是通过烧灼或者冷冻方式祛除，避免发生性伴侣交互传染。

再者，排除是不是由于肛门内侧有息肉，甚至肿瘤生长，及时做病理组织学诊断，一般通过手术进行治疗。