鼻咽癌活检结果呈现阴性，主要是说明患者的鼻腔内的新生物的病理活检结果，显示并没有EB病毒感染的情况出现。

此类患者往往并不是鼻咽癌等疾病，而是鼻炎上皮性病变。此类疾病的鼻炎病理免疫组化CK检查可能同样呈现阳性，但是活检原位杂交呈现阴性。

鼻咽癌的病理活检检查，是确诊患者是否患有鼻咽癌的金标准。部分疾病可能和鼻咽癌的临床表现或者是影像学检查表现有相似点，进行鼻咽癌的病理活检，也可以起到区分和鉴别不同疾病的功效。