巧克力囊肿是可以做试管的。

因为很多巧克力囊肿的患者会导致盆腔的广泛粘连，盆腔微环境遭到破坏，影响输卵管的功能，也会影响卵巢的排卵功能，会导致排卵障碍，黄体形成不良，引起不孕不育，或者是宫外孕。即使通过手术治疗，也很容易复发，而且也会明显地影响自然怀孕的几率，所以如果巧克力囊肿手术后备孕困难者还是可以考虑试管婴儿。巧克力囊肿做试管婴儿的成功率还是挺高的，但是巧克力囊肿患者如果做试管婴儿，也要加强监护，要监测体内的激素水平。必要的时候要进行保胎治疗，尤其是在怀孕早期，要注意休息，不要剧烈运动，要补充叶酸预防胎儿神经管畸形。