由于膈下脓肿是继发感染，其部位与原发疾病有关。常见并发症有以下几种：

1.膈下感染可引起反应性胸腔积液，或经淋巴途径扩散至胸部引起胸膜炎，也可穿透胸部引起脓胸。

2.消化道出血和消化道瘘可因脓肿而腐蚀消化道壁，引起反复出血、肠瘘或胃瘘。

3.贫血。

膈下脓肿在早期诊断中，应及时选择手术切开引流。引流应在右肝裸区局麻下进行，术后积极选择静脉抗感染治疗。通常需要联合应用头孢菌素和甲硝唑，以及静脉营养支持治疗，并补充红细胞和血浆。