肛瘘不治疗一般是不会自己好的。

肛瘘属于感染性质的疾病，是由于肛周脓肿发生溃破之后遗留下了管道，并且会在肛门周围形成外口，外口通过管道和肛内相通，会反复地流脓和流水。如果不进行治疗，肛瘘的管道会持续地存在，会反复地刺激肛门局部，出现潮湿、瘙痒等不适的症状，还可能会引起肛门的疼痛。严重的会由低位的肛瘘发展成高位的肛瘘，由简单的肛瘘发展成复杂性的肛瘘。

肛瘘在诊断明确以后，建议患者早做手术治疗。单纯地通过非手术的药物保守治疗，效果也不理想，主要就是以缓解症状为主，容易再次出现临床症状。肛瘘在手术治疗以后也要按时换药，促进伤口的愈合，减少术后复发的几率。