卵巢囊肿切除手术以后是有可能会复发的，尤其是卵巢的子宫内膜异位囊肿，也就是巧克力囊肿，在手术以后是非常容易复发的。卵巢子宫内膜异位囊肿多发生于生育年龄的女性，是盆腔子宫内膜异位症的一种表现形式。

卵巢的巧克力囊肿一般进行囊肿剥除手术以后，建议要给予三到六个疗程的巩固药物治疗，避免卵巢囊肿的复发。对于生育年龄的女性，准备要孩子可以在术后尽快怀孕，怀孕是对卵巢、子宫内膜异位囊肿的一种治疗手段。

如果能够在术后三个月以内怀孕，卵巢囊肿复发的可能性就会相对减少。但是在生育功能完成以后，仍然是有可能会复发的。所以，卵巢巧克力囊肿切除以后，要定期进行复查。