苯丙酮尿症有可能会隔代遗传。

苯丙酮尿症是一种罕见的常染色体隐性遗传疾病，氨基酸代谢异常。根据不同的基因突变，可分为经典的苯丙酮尿​​症，其突变基因是PAH基因；非经典苯丙酮尿症，其突变基因是BH4基因。

常染色体隐性遗传仅在父母双方携带缺陷基因，并将其遗传给子女时才涉及苯丙酮尿症。如果父母一方是携带者，则可能导致携带苯丙酮尿症的缺陷基因，而不携带疾病，儿童没有遗传疾病的风险，但可能是携带者。大多数情况下，苯丙酮尿症的父母双方都是缺陷基因的携带者。