支原体感染主要是由肺炎支原体引起的，呼吸道和肺部的急性炎症改变。临床主要表现为发热、咳嗽、咳痰、咽痛、头痛、腹泻等症状，咳嗽多表现为阵发性的剧烈呛咳。

而百日咳是一种急性呼吸道传染病，是由于感染了百日咳杆菌而引起的。临床主要表现为阵发性、痉挛性咳嗽，咳嗽的终末期，常出现深长的鸡鸣样、吸气性吼声。病程比较长，一般可以长达2到3个月左右，所以又称为百日咳。

百日咳的传染性非常强，经过呼吸道以及飞沫传播。