两只脚关节疼痛，有可能是因为脚关节的体力劳动过后的劳损，和过度运动引起的损伤筋膜炎导致。

还有一些创伤性的关节炎的因素。原先脚关节有骨折、脱位或者损伤，因为关节面的不平整，引起创伤性关节炎，软骨破坏导致活动后的疼痛。

还有一些炎症类的疾病。比如风湿类风湿性关节炎引起脚关节的炎症性的破坏。还有一些老年性的骨关节炎引起骨质退变、增生、骨关节炎导致。还有一些软组织的感染引起软组织破坏、骨质的侵犯，也可以导致脚关节疼痛。